MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4719

Total Repeats: 372

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014133	CAA	2	6	331	336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100282
2	NC_014133	CTA	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100282
3	NC_014133	GTGA	2	8	460	467	25 %	25 %	50 %	0 %	296100282
4	NC_014133	A	7	7	480	486	100 %	0 %	0 %	0 %	296100282
5	NC_014133	TTG	2	6	592	597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100282
6	NC_014133	CAT	2	6	661	666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100282
7	NC_014133	CTA	2	6	721	726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100282
8	NC_014133	GCAC	2	8	743	750	25 %	0 %	25 %	50 %	296100282
9	NC_014133	ACA	2	6	797	802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100282
10	NC_014133	ATC	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100283
11	NC_014133	TTG	2	6	1046	1051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100283
12	NC_014133	AATC	2	8	1142	1149	50 %	25 %	0 %	25 %	296100283
13	NC_014133	AGC	2	6	1194	1199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100283
14	NC_014133	ATC	2	6	1222	1227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100284
15	NC_014133	TGGT	2	8	1326	1333	0 %	50 %	50 %	0 %	296100284
16	NC_014133	AAT	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100284
17	NC_014133	CAAT	2	8	1577	1584	50 %	25 %	0 %	25 %	296100285
18	NC_014133	GAA	2	6	1621	1626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100285
19	NC_014133	ATT	2	6	1666	1671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100285
20	NC_014133	ATG	2	6	1688	1693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100285
21	NC_014133	GAC	2	6	1726	1731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100285
22	NC_014133	ATT	2	6	1734	1739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100285
23	NC_014133	GTT	2	6	1939	1944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100285
24	NC_014133	GAA	2	6	2019	2024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100285
25	NC_014133	AATC	2	8	2088	2095	50 %	25 %	0 %	25 %	296100285
26	NC_014133	TAA	2	6	2262	2267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100285
27	NC_014133	GAA	2	6	3430	3435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100286
28	NC_014133	T	6	6	3469	3474	0 %	100 %	0 %	0 %	296100286
29	NC_014133	ACC	2	6	3481	3486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296100286
30	NC_014133	GTT	2	6	3583	3588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100286
31	NC_014133	ATA	2	6	3593	3598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100286
32	NC_014133	A	6	6	3598	3603	100 %	0 %	0 %	0 %	296100286
33	NC_014133	AAG	2	6	3626	3631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100286
34	NC_014133	TGC	2	6	3692	3697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100287
35	NC_014133	A	6	6	3760	3765	100 %	0 %	0 %	0 %	296100287
36	NC_014133	A	6	6	3789	3794	100 %	0 %	0 %	0 %	296100287
37	NC_014133	GAA	2	6	3811	3816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100287
38	NC_014133	TGA	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100287
39	NC_014133	TGA	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100287
40	NC_014133	GAA	2	6	3990	3995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100287
41	NC_014133	AGA	2	6	4023	4028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100287
42	NC_014133	CAG	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100287
43	NC_014133	AACAGC	2	12	4133	4144	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	296100287
44	NC_014133	TATGC	2	10	4150	4159	20 %	40 %	20 %	20 %	296100287
45	NC_014133	ATT	2	6	4326	4331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100288
46	NC_014133	ACA	2	6	4354	4359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100288
47	NC_014133	TAGT	2	8	4394	4401	25 %	50 %	25 %	0 %	296100288
48	NC_014133	ATG	2	6	5220	5225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100289
49	NC_014133	GTG	2	6	5274	5279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100289
50	NC_014133	AAC	2	6	5324	5329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100289
51	NC_014133	CAG	2	6	5338	5343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
52	NC_014133	ACCGCC	2	12	5373	5384	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	296100289
53	NC_014133	TA	3	6	5389	5394	50 %	50 %	0 %	0 %	296100289
54	NC_014133	ATG	2	6	5418	5423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100289
55	NC_014133	AGT	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100289
56	NC_014133	TGG	2	6	5587	5592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100289
57	NC_014133	GCC	2	6	5724	5729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296100289
58	NC_014133	GCAG	2	8	5732	5739	25 %	0 %	50 %	25 %	296100289
59	NC_014133	CAG	3	9	5737	5745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
60	NC_014133	AGC	2	6	5750	5755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
61	NC_014133	GCG	2	6	5769	5774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100289
62	NC_014133	GCA	2	6	5784	5789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
63	NC_014133	AGC	2	6	5795	5800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
64	NC_014133	GGC	2	6	5810	5815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100289
65	NC_014133	AGC	3	9	5825	5833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
66	NC_014133	GGC	2	6	5840	5845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100289
67	NC_014133	AGC	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
68	NC_014133	GCG	2	6	5874	5879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100289
69	NC_014133	AGC	3	9	5885	5893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
70	NC_014133	AGC	2	6	5900	5905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
71	NC_014133	GCG	2	6	5919	5924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100289
72	NC_014133	GCA	2	6	5934	5939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
73	NC_014133	AGC	3	9	5945	5953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
74	NC_014133	GGC	2	6	5960	5965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100289
75	NC_014133	AGC	2	6	5984	5989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
76	NC_014133	AAG	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100289
77	NC_014133	ACA	2	6	6072	6077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100289
78	NC_014133	GAT	2	6	6078	6083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100289
79	NC_014133	ATG	2	6	6087	6092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100289
80	NC_014133	CAA	2	6	6142	6147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100289
81	NC_014133	GTT	2	6	6237	6242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100289
82	NC_014133	CAA	2	6	6283	6288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100289
83	NC_014133	ACG	2	6	6454	6459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
84	NC_014133	CAG	2	6	6505	6510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
85	NC_014133	CTA	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100289
86	NC_014133	CTA	2	6	6523	6528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100289
87	NC_014133	CAC	2	6	6544	6549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296100289
88	NC_014133	AAG	2	6	6597	6602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100289
89	NC_014133	CGA	2	6	6617	6622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100290
90	NC_014133	GTC	2	6	6719	6724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100290
91	NC_014133	ATT	2	6	6918	6923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100290
92	NC_014133	TAT	2	6	7010	7015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100290
93	NC_014133	CGT	2	6	7077	7082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100290
94	NC_014133	TCA	2	6	7127	7132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100290
95	NC_014133	CAT	2	6	7134	7139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100290
96	NC_014133	TCA	3	9	7178	7186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100290
97	NC_014133	A	7	7	7186	7192	100 %	0 %	0 %	0 %	296100290
98	NC_014133	AGT	2	6	7204	7209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100290
99	NC_014133	ACT	2	6	7235	7240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100290
100	NC_014133	A	6	6	7241	7246	100 %	0 %	0 %	0 %	296100290
101	NC_014133	CAA	2	6	7254	7259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100290
102	NC_014133	A	7	7	7265	7271	100 %	0 %	0 %	0 %	296100290
103	NC_014133	TTG	2	6	7299	7304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100290
104	NC_014133	GA	3	6	7331	7336	50 %	0 %	50 %	0 %	296100290
105	NC_014133	TAAA	2	8	7345	7352	75 %	25 %	0 %	0 %	296100290
106	NC_014133	GAAA	2	8	7706	7713	75 %	0 %	25 %	0 %	296100291
107	NC_014133	ATT	2	6	7724	7729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100291
108	NC_014133	A	6	6	7736	7741	100 %	0 %	0 %	0 %	296100291
109	NC_014133	A	6	6	7749	7754	100 %	0 %	0 %	0 %	296100291
110	NC_014133	AGTT	2	8	7781	7788	25 %	50 %	25 %	0 %	296100291
111	NC_014133	TTG	2	6	7810	7815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100291
112	NC_014133	TGCG	2	8	7855	7862	0 %	25 %	50 %	25 %	296100291
113	NC_014133	TCA	2	6	7884	7889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100291
114	NC_014133	ATC	2	6	7930	7935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100291
115	NC_014133	TTGA	2	8	7959	7966	25 %	50 %	25 %	0 %	296100291
116	NC_014133	AAC	2	6	8128	8133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100291
117	NC_014133	AATT	2	8	8233	8240	50 %	50 %	0 %	0 %	296100291
118	NC_014133	TGA	2	6	8252	8257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100291
119	NC_014133	TGA	2	6	8312	8317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100291
120	NC_014133	TGT	2	6	8318	8323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100291
121	NC_014133	ATT	2	6	8325	8330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100291
122	NC_014133	GCA	2	6	8421	8426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100291
123	NC_014133	GTT	2	6	8433	8438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100291
124	NC_014133	GGCA	2	8	8452	8459	25 %	0 %	50 %	25 %	296100291
125	NC_014133	TGA	2	6	8465	8470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100291
126	NC_014133	AAG	2	6	8506	8511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100291
127	NC_014133	GTT	2	6	8585	8590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100291
128	NC_014133	GCA	2	6	8601	8606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100291
129	NC_014133	TGA	2	6	8638	8643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100292
130	NC_014133	TAT	2	6	8652	8657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100292
131	NC_014133	TA	3	6	8680	8685	50 %	50 %	0 %	0 %	296100292
132	NC_014133	TAT	2	6	8720	8725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100292
133	NC_014133	TAAT	2	8	8761	8768	50 %	50 %	0 %	0 %	296100292
134	NC_014133	ACT	2	6	8780	8785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100292
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137	NC_014133	TTTGGC	2	12	8838	8849	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	296100292
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261	NC_014133	TGA	2	6	16277	16282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100299
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265	NC_014133	ACT	2	6	16550	16555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100299
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269	NC_014133	GTG	2	6	16831	16836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100299
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372	NC_014133	TAA	2	6	21908	21913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100302

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.